Tác động của dịch bệnh Covid-19 dẫn đến một số khó khăn và tạo áp lực, tăng chi phí Logistic … trong hoạt động vận tải biển của các chủ tàu và các doanh nghiệp hoạt động hàng hải khác. Liên quan đến lĩnh vực phí, lệ phí hàng hải, Chính phủ đã và đang triển khai nhiều giải pháp để hỗ trợ doanh nghiệp, trong đó Thủ tướng Chính phủ có Chỉ thị số 11/CT-TTg ngày 04/03/2020 về các nhiệm vụ, giải pháp cấp bách tháo gỡ khó khăn cho sản xuất kinh doanh, đảm bảo an sinh xã hội, ứng phó với dịch bệnh Covid-19, theo đó có yêu cầu các bộ ngành trong phạm vi và lĩnh vực quản lý, rà soát để ban hành theo thẩm quyền việc giảm phí, lệ phí đối với các đối tượng chịu ảnh hưởng bởi dịch bệnh hoặc đề xuất phương án giảm phí, lệ phí gửi về Bộ Tài chính.

Đối với hoạt động vận tải biển nói chung hay hoạt động kinh doanh khai thác cảng của gần 60 doanh nghiệp trong khu vực trách nhiệm quản lý của Cảng vụ hàng hải Vũng Tàu và hoạt động vận tải biển của các hãng tàu nước ngoài hiện đang khai thác các tàu container trọng tải lớn trên tuyến nội Á, Châu Âu hay bờ Đông- bờ Tây nước Mỹ hoặc hoạt động của các phương tiện thủy nội địa trên tuyến vận tải  thủy từ Việt Nam đi Campuchia và ngược lại trong khuôn khổ "Hiệp định giữa Chính phủ nước CHXHCN Việt Nam và Chính phủ Hoàng gia Campuchia về vận tải đường thuỷ" nói riêng, trên cơ sở chỉ đạo của cấp thẩm quyền, thời gian qua Cảng vụ Hàng hải Vũng Tàu đã tích cực phối hợp với chủ tàu, doanh nghiệp cảng và doanh nghiệp liên quan tổ chức nghiên cứu, đánh giá tác động, ảnh hưởng và thống nhất kiến nghị nhà nước xem xét, có chính sách giảm phí, lệ phí hàng hải cho một số đối tượng hoạt động động đặc thù, chịu tác động tiêu cực của dịch bệnh Covid-19 nhằm hỗ trợ doanh nghiệp ổn định sản xuất, duy trì, nâng cao công suất khai thác của cụm cảng nước sâu khu vực Cái Mép – Thị Vải. Bên cạnh đó, Cảng vụ Hàng hải Vũng Tàu đã định kỳ tổ chức các Hội nghị hoặc thông qua các phương thức phù hợp để trao đổi, tiếp thu kiến nghị và phối hợp với cơ quan thẩm quyền xem xét, giải quyết khó khăn, vướng mắc cho doanh nghiệp, đồng thời với việc đẩy mạnh và tăng cường hiệu quả công tác cải cách thủ tục hành chính, vì sự hài lòng hơn của người dân và doanh nghiệp./.